معظم له در دیدار جمعی از اساتید حوزه علمیه قم با اشاره به اینکه امیرالمؤمنین (ع) انسان‌ها را به نظم توصیه می‌کردند اظهار داشت: برخی در دورانی طرفدار این بودند که نظم آنها در بی‌نظمی است و البته شکی نیست جامعه‌ای که از هر طرف مورد هدف است اگر دارای تشکل و نظم نباشد فورا از هم می‌پاشد.
وی با اشاره به اینکه در شرایط کنونی دشمن از طریق ماهواره‌ها ایمان نسل جوان و حوزه را هدف قرار داده است به وضعیت تحصیل طلاب در حوزه اشاره کرد و بیان داشت: استاد باید از سوی طلاب انتخاب شده و اساتید انتخابی باشند.
معظم له گفت: در نظام پیشین وقتی دانشگاهیان به سراغ ما می‌آمدند، می‌گفتند که روش حوزه بهتر از دانشگاه است چرا که این مسئله موجب پیشرفت استاد می‌شود.
ايشان در ادامه با تاکید بر ضرورت حفظ تفکر سیاسی و اخلاق در حوزه‌های علمیه افزود: باید تفکر سیاسی در حوزه که عبارت از ولایت فقیه، تبعیت از کتاب و سنت و تبعیت از مراجع است شکل گرفته و فقه باید همیشه حاکم بوده و طلاب نیز طالب چنین سیاستی باشند.
آیت‌الله سبحانی تصریح کرد: از زمانی که مرجعیت آغاز شده است حوزه‌های علمیه تابع مراجع بوده و آنها خط‌دهی داشتند و حتی حضرت امام نیز که فکر انقلابی بیشتری داشت در زمان آقای بروجردی یک کلمه بحث سیاسی نداشتند.
وی با اشاره به اینکه خط سیاسی ما باید خط سیاسی روحانیت، ولایت اهل‌بیت، ولایت فقیه و مراجع باشد گفت: این اصالت باید حفظ شود و اخلاق محوری نیز از اهمیت زیادی برخوردار است و اگر اخلاق نباشد همه چیز از هم می‌پاشد.
معظم له با اشاره به اینکه اساتید حوزه باید تفکر و برنامه‌ریزی کرده و از نظر فکر سیاسی و فکر اخلاقی طلاب را راهنمایی کنند تصریح کرد: باید نسبت به ارتقای سطح علمی طلاب هر چه بیشتر اهمیت داده شود.
ايشان اضافه کرد: حفظ موقعیت علمی طلاب باید مورد توجه جدی قرار گیرد و طلبه‌ای که لمعه را خوب نخوانده سراغ مکاسب و رسائل نرود. علم طلاب در کنار اندیشه سیاسی و اخلاقی اهمیت زیادی دارد.
آیت‌الله سبحانی با اشاره به توهین صورت گرفته از سوی یک خواننده با ساحت امام هادی (ع) تاکید کرد: فردی شعری درباره حضرت هادی (ع) گفته و این شعر در سایت‌ها منتشر شده است و در شرایط کنونی ما در حال دفاع هستیم، این در حالی است که ما باید موضع تهاجمی داشته باشیم و اشکالات آنها را بگوییم، نباید شرایط به گونه‌ای باشد که آنها هجوم آورده و ما دفاع کنیم.
وی با اشاره به اینکه طلاب باید آماده دفاع و همچنین هجوم به دشمن باشند تصریح کرد: هجمه‌ها نسبت به اسلام و شیعه فراوان است و دشمنان ما بسیار زیاد هستند.
معظم له گفت: البته تشیع به دلیل قوت منطق در حال نفوذ در سرتاسر عالم است و دشمنان از تشیع می‌ترسند.